対応のある分割表 (クロス集計表) [直接入力]
解説
McNemar検定 - 対応のある比率の比較
McNemar検定は、関連する二値変数(例えば、前後の治療効果や診断法の効果など)において、それらの間での変化や差を統計的に評価するための手法です。
検定の帰無仮説は「2つの測定間で変化の方向性に差がない」というものです。
この検定は特に、同じサンプルに対して2回異なる条件や時点での測定を行った際に、その前後の変化を調査するのに適しています。
例: 新しい診断法の評価
ある疾患に対する新規診断法Aについて、既存の診断法Bと比較して、その効果を評価する場合を想定します。 100名の患者に対する、両方の診断法の結果は以下の通りです。
方法B: 陽性 | 方法B: 陰性 | |
---|---|---|
方法A: 陽性 | 40 | 5 |
方法A: 陰性 | 10 | 45 |
このテーブルから、以下の情報を読み取ることができます:
- 40人は両方の方法で陽性と診断されました。
- 45人は両方の方法で陰性と診断されました。
- 5人は方法Aで陽性、方法Bで陰性と診断されました。
- 10人は方法Aで陰性、方法Bで陽性と診断されました。
McNemar検定では、主に対角線上にないセルの値 (この例では5と10) の違いに注目します。 これらのセルは、異なる方法で異なる結果が得られたケースを表しています。 一方、対角線上のセルは、両方の方法で同じ結果 (陽性または陰性) が得られた患者の数を示しており、McNemar検定ではこの部分の値の差異には注目しません。 つまり、McNemar検定は、異なる方法によって結果が変わったケース対して行われます。
検定の前提条件
- データは対応のある (マッチした) ペアである必要があります
- 各測定値は互いに独立している必要があります
- 測定値は二値 (2カテゴリー) である必要があります
検定の実施
補正なしの場合: \[ χ^2 = \frac{(5 - 10)^2}{(5 + 10)} = \frac{25}{15} = 1.67 \]
小さいサンプルサイズで、連続性の補正(Yatesの補正)を適用する場合: \[ χ^2 = \frac{(|5 - 10| - 1)^2}{(5 + 10)} = \frac{16}{15} = 1.0667 \]
(ここでは補正値として 1 を引いていますが、0.5 を用いる場合も多いです。R の mcnemar.test に合わせてここでは 1 にしています。)
この結果はカイ二乗分布の自由度1のもとで評価されます。 ここで得られた値が有意水準 (例えば0.05) よりも小さい場合、方法Aと方法Bの間に有意な差があると結論付けることができます。
解釈
この例では、5人と10人の間には5人の差があるので、新しい診断方法Aが既存の方法Bと異なる可能性が示唆されます。 しかし、McNemar検定 (補正あり) の結果、χ2統計量: 1.0667, p値: 0.3017 となりますので、有意差はありません。
注意点
- McNemar検定は、サンプルがマッチしたペア (たとえば、同じ患者の前後の治療結果) である場合や、同一対象者に対する反復測定のデータに適用されます。
- 独立した2つのサンプル群 (例えば、異なる患者群間の比較) に対しては使用することは適切ではありません。
- 一般的に、非対角要素の合計が10以上の場合は補正なしの検定を、10未満の場合は連続性の補正を適用することが推奨されます。
- 効果の大きさを評価する場合は、オッズ比 (b/c) とその95%信頼区間も併せて報告することが推奨されます。
Bowker検定 (McNemar-Bowkerの対称検定) - 3×3以上の分割表での対称性の評価
Bowker検定は、3値以上のカテゴリーを持つ対応のあるデータに適用できる検定手法で、McNemar検定を拡張したものです。
Bowker検定は、同じ対象に対して2回以上の測定を行った際の結果が3値以上のカテゴリーを持つ場合に、これらのカテゴリー間での変化が偶然によるものかどうかを検定します。 すなわち、McNemar検定が2×2の分割表に対して用いられるのに対し、Bowker検定は3×3またはそれ以上の分割表に対して用いることができます。
検定の帰無仮説は「対称位置にあるセルの確率が等しい (変化の対称性がある)」というものです。
例: ある治療法の結果の評価
例えば、ある治療法が3つの異なる結果 (改善、不変、悪化)を生じさせる可能性がある場合、同一の患者群に対して治療前後での状態変化を3×3のテーブルで表し、治療による効果の有無を統計的に評価します。
方法B: 改善 | 方法B: 不変 | 方法B: 悪化 | 合計 | |
---|---|---|---|---|
方法A: 改善 | 12 | 18 | 10 | 40 |
方法A: 不変 | 9 | 8 | 29 | 46 |
方法A: 悪化 | 8 | 13 | 10 | 31 |
合計 | 29 | 39 | 49 | 117 |
検定の前提条件
- データは対応のある (マッチした) ペアである必要があります
- 各測定値は互いに独立している必要があります
- カテゴリーは互いに排他的である必要があります (1つのケースが同時に複数のカテゴリーに属することはできません)
- カテゴリーの順序は問いません (順序尺度である必要はありません)
注意点
- 小さいサンプルサイズでは、統計的な検出力が低下する可能性があります。
- カテゴリー数が増えるほど、必要なサンプルサイズも大きくなります。
- セルの期待度数が小さい場合 (一般的に5未満)、検定の信頼性が低下する可能性があります。
Stuart-Maxwell検定 - 周辺分布の同質性の評価
Stuart-Maxwell検定は、対応のあるカテゴリカルデータにおいて、周辺分布の同質性 (marginal homogeneity) を評価するための統計的手法です。
このテストは、各評価者がそれぞれのカテゴリーをどの程度の割合で使用しているかの差を評価します。例えば、評価者Aと評価者Bで、すべてのカテゴリーの使用頻度に偏りがないかを検証します。
Bowker検定との違い
- Bowker検定:対称性を評価 (例: 「改善→悪化」と「悪化→改善」の変化が同じ確率で起こるか)
- Stuart-Maxwell検定:周辺分布の同質性を評価 (例: 評価者AとBでそれぞれのカテゴリーの診断割合に差があるか)
例: ある治療法の結果の評価 例えば、ある治療法の前後での状態変化を評価する場合:
方法B: 改善 | 方法B: 不変 | 方法B: 悪化 | 合計 | |
---|---|---|---|---|
方法A: 改善 | 12 | 18 | 10 | 40 |
方法A: 不変 | 9 | 8 | 29 | 46 |
方法A: 悪化 | 8 | 13 | 10 | 31 |
合計 | 29 | 39 | 49 | 117 |
このような場合、以下を評価できます:
- 方法Aは「改善」が40例 (34.2%)、「不変」が46例 (39.3%)、「悪化」が31例 (26.5%)
- 方法Bは「改善」が29例 (24.8%)、「不変」が39例 (33.3%)、「悪化」が49例 (41.9%)
- このようなすべてのカテゴリーにおける割合の違いが統計的に有意かどうかを検定
検定の前提条件
- データは対応のある (マッチした) ペアである必要があります
- 各測定値は互いに独立している必要があります
- カテゴリーは互いに排他的である必要があります
- カテゴリーの順序は検定結果に影響しません
注意点
- 小さいサンプルサイズでは、統計的な検出力が低下する可能性があります
- カテゴリー数が増えるほど、必要なサンプルサイズも大きくなります
- セルの期待度数が小さい場合、検定の信頼性が低下する可能性があります
- 検定結果の解釈は、臨床的な文脈を考慮して行う必要があります
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---|---|
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分類内容 | 値 | |
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データの取り扱い
- データインポート
- データの読み込みは、ブラウザ内で完結し、外部へのデータ送信は発生しません。
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- 読み込んだデータはブラウザ内に保持されます。
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- 最小限のデータ送信
- 外部のAIサーバーへ送信されるデータは、クラウド R の出力結果と、用いた統計手法の徐放です。
- ただし、クラウド R の出力結果に連続した数値データが含まれる場合は、AI にデータ形式を認識させる目的で、連続データの最初の行のみを送信します。
- クラウド R 出力結果の保持
- AI による解説内容は、将来の品質向上などのため、サーバーがデータベースに保持します。
- その際に、送信者の情報や、計算元となるデータなど、プライバシーに関わる情報は保持しません。
Reactive stat において、統計データの変数は、通常の数値や文字列として扱われます。 したがって、日付や時間の概念は直接的にはサポートされていません。
統計計算を行う際には、日付や時間の差分を数値として事前に用意しておく必要があります。
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データ
設定
結果
McNemar検定の結果
Bowker検定 (McNemarの検定の拡張, McNemar-Bowkerの対称検定) の結果
Bowker検定は2x2より大きな表のためのMcNemarの検定の一般化されたバージョンです。この検定は、表の主対角線に関する対称性を検定します。
Bowker検定を使用する場合、サンプルサイズが十分であることを確認することが重要です。サンプルサイズが小さい場合、カイ二乗の近似が信頼できない可能性があります。
補正なし
補正あり
この2x2表では、非対角要素が等しいため、連続性の補正は適用されません。
3x3以上の表では、連続性の補正は適用されません。
Stuart-Maxwell 検定
3×3以上の場合に、対応のある名義尺度データの周辺同質性を検定します。
この検定は、「すべての周辺確率が等しい」という帰無仮説を検定します。
特徴
- Bowker検定より検出力が高いとされる
- カテゴリーデータを名義尺度として扱う (例: 軽症/中等症/重症 などの順序性は考慮しない)
用途
- 評価基準の変化の検出
- 評価者間の系統的な偏りの評価
クラウド R 分析